La Voie Lactée est une école primaire spécialisée. Elle a été créée en 1986 par deux psychopédagogues :

Danièle Bellet et Dina Borel.
En 1989, La Voie Lactée s'installe dans la commune de Meyrin au 32 promenade des Champs-Fréchets.

Dès lors, La Voie Lactée a développé une collaboration avec les autorités meyrinoises.
Le 23 septembre 1994, reconnaissance de La Voie Lactée, par le Grand Conseil du canton de Genève, comme école spécialisée d'utilité publique.
Le 24 février 1999, reconnaissance par l'office fédérale des assurances sociales (OFAS) comme école spécialisée auprès de l'assurance invalidité (AI).

L'Association La Voie Lactée, constituée le 12 juillet 1999, a repris l'exploitation de l'école au 1er janvier 2000, nommant Dina Borel directrice.

L'association est enregistrée au Registre du Commerce.
En 2008, l'école devient subventionnée par la République et le canton de Genève.  Désormais, elle fait partie du réseau genevois de l'enseignement spécialisé.
En 2011, Roland Russi reprend la direction de l'école et Dina Borel reste à la direction pédagogique.
En 2013, la commune de Meyrin propose à La Voie Lactée de faire partie des équipements publics du futur quartier des Vergers. 
De 2014 à 2018, construction des 4 bâtiments des équipements publics des Vergers:  
         - L'école primaire des Vergers
         - L'école La Voie Lactée 
         - L'aula et les locaux parascolaires 
         - Les salles de sport 
En août 2018, notre école s'est installée dans ses nouveaux locaux aux Vergers.
Depuis le 1er janvier 2019, avec l'arrivée des élèves de l'école publique des Vergers, entrée en vigueur d'une convention de partage et de mise à disposition des locaux publics des Vergers et de ceux de La Voie Lactée.

En 2021, Monsieur Pierre-Alain Tschudi est nommé président de l'Association.